Исход предмета:
Након успешно реализованих предиспитних и испитних обавеза студент може да:
- разликује и правилно одабере генетичке маркере у еколошко генетичким студијама
- разуме методе квантификовања генетичког диверзитета и предеоне хетерогености
- идентификује корелације предеоне хетерогености и генетичке варијабилности
- објасни методологију праћења промена генофона популације у промењивим условима средине
- са разумевањем користи интернет изворе и стручну литературу из области
|
Садржај предмета:
Теоријска настава
Увод у еколошку генетику. Селективно неутрални генетички маркери. Генетички маркери адаптације. Организације генетичких варијација унутар и између популација. Фактори који утичу на структуру генофонда. Популациона динамика у промењивим условима средине. Генетички мониторинг природних популација. Интеракције генотипа и средине. Фенотипска пластичност. Генетичка диференцијација и адаптивна пластичност. Предеона генетика. Методе квантификације предеоне хетерогености и генетичког диверзитета. Корелација података предеоне хетерогености и генетичких полиморфизама. Еколошке нише одабраних таксона формираних на основу фактора средине и дистрибуције врста.
Практична настава Одређивање генетичке структуре природних популација. Израчунавање параметара генетичког диверзитета и диференцијације. Примена програмских пакета у одређивању просторне и временске структуре и динамике популација. PCA и IBD анализе. Кластер методе у еколошкој генетици. Моделовање у еколошкој генетици. Формирање еколошких ниша на основу потенцијалне дистрибуције одабраних таксона. Израчунавање процента преклапања ниша коришћењем Schoener's D индекса. Утврђивање да ли су еколошке нише између таксона идентичне у односу на нулту хипотезу (Идентични тест). Утврђивање да ли се еколошке нише између таксона мање или више разликују у односу на нулту хипотезу (тест Сличности). Израчунавање статистичке значајности еколошких ниша у односу на нулту хипотезу применом t-теста и Fisher теста. Утврђивање степена дивергенције између сродних таксона. Поређење еколошких ниша у односу на глобалне климатске промене.
|
Литература:
Conner J, Hartl D. A Primer of Ecological Genetics Sinauer Associates, Inc., USA, 2004.
Balkenhol N, Cushman S, Storfer A, Waits L. Landscape Genetics: Concepts, Methods, Applications. Wiley-Blackwell, 2015.
Lowe A, Harris S, Ashton P. Ecological Genetics: Design, Analysis and Application. Wiley-Blackwell, 2004.
|